2021/08/31 更新

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キモリ ヨシタカ
木森 義隆
Yoshitaka Kimori

学位

  • 博士(情報工学)   課程 ( 2006年9月   九州工業大学 )

研究キーワード

  • 特徴抽出

  • パターン認識

  • セグメンテーション

  • 画像解析

研究分野

  • 情報通信 / 知能ロボティクス

  • 情報通信 / 知覚情報処理

  • ライフサイエンス / 医用システム

学歴

  • 九州工業大学   情報工学部   生命情報工学科   卒業

    1997年4月 - 2001年3月

  • 九州工業大学   大学院 情報工学研究科   情報科学専攻   博士前期課程   修了

    2001年4月 - 2003年3月

  • 九州工業大学   大学院 情報工学研究科   情報科学専攻   博士後期課程   単位取得満期退学

    2003年4月 - 2006年3月

経歴

  • 東京大学   医科学研究所   技術補佐員

    2006年4月 - 2006年9月

  • 東京大学   医科学研究所   産学官連携研究員

    2006年10月 - 2008年7月

  • 国立精神・神経医療センター   神経研究所   研究員

    2008年8月 - 2010年3月

  • (財)医療機器センター   流動研究員

    2008年8月 - 2010年3月

  • 自然科学研究機構 新分野創成センター   イメージングサイエンス研究分野   専門研究職員

    2010年4月 - 2011年9月

  • 自然科学研究機構 新分野創成センター   イメージングサイエンス研究分野   特任助教

    2011年10月 - 2018年3月

  • 自然科学研究機構 基礎生物学研究所   進化多様性生物学領域   特任助教 (兼任)

    2013年4月 - 2018年3月

  • 福井工業大学   環境情報学部   准教授

    2018年4月 - 2021年3月

  • 福井工業大学   環境情報学部   教授

    2021年4月 - 現在

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所属学協会

  • IEEE

  • 電子情報通信学会

 

論文

  • Aggregation of Partially Unfolded Myosin Subfragment-1 into Spherical Oligomers with Amyloid-Like Dye-Binding Properties 査読

    Komatsu H., Shinotani N., Kimori Y., Tokuoka J., Kaseda K., Nakagawa H., Kodama T.

    Journal of Biochemistry139   989 - 996   2006年6月

  • Procedure to Analyze Surface Profiles of the Protein Molecules Visualized by Quick-Freeze Deep-Etch Replica Electron Microscopy 査読

    Kimori Y., Oguchi Y., Ichise N., Baba N., Katayama E.

    Ultramicroscopy107   25 - 39   2007年1月

  • Extended Morphological Processing: A Practical Method for Automatic Spot Detection of Biological Markers from Microscopic Images 査読

    Kimori Y., BabaN., Morone N.

    BMC Bioinformatics11   373   2010年7月

  • Fractal Dimension Analysis and Mathematical Morphology of Structural Changes in Actin Filaments Imaged by Electron Microscopy 査読

    Kimori Y., Katayama E., Morone N., Kodama T.

    Journal of Structural Biology176   1 - 8   2011年10月

  • Myostatin-deficient medaka Exhibit a Double-muscling Phenotype with Hyperplasia and Hypertrophy, which Occur Sequentially During Post-hatch Development 査読

    Chisada S., Okamoto H., Taniguchi Y., Kimori Y., Toyoda A., Sakaki Y., Takeda S., Yoshiura Y.

    Developmental Biology359   82 - 94   2011年11月

  • Mathematical Morphology-based Approach to the Enhancement of Morphological Features in Medical Images 査読

    Kimori Y.

    Journal of Clinical Bioinformatics1   33   2011年12月

  • Gamma-ray irradiation promotes premature meiosis of spontaneously differentiating testis-ova in the testis of p53 deficient medaka (Oryzias latipes) 査読

    Yasuda T., Oda S., Li Z., Kimori Y., Kamei Y., Tomoko I., Todo T., Mitani H.

    Cell Death and Disease3   e395   2012年10月

  • Novel Configuration of A Myosin II Transient Intermediate Analogue Revealed by Quick-Freeze Deep-Etch Replica Electron Microscopy 査読

    Kimori Y., Baba N., Katayama E.

    Biochemical Journal450   23 - 35   2013年2月

  • Morphological Image Processing for Quantitative Shape Analysis of Biomedical Structures: Effective Contrast Enhancement 査読

    Kimori Y.

    Journal of Synchrotron Radiation20   848 - 853   2013年11月

  • 形状解析のための画像処理:mathematical morphologyに基づく画像コンポーネントの抽出 査読

    木森義隆

    Cytometry Research24   15 - 20   2014年10月

  • Single-Cell Phenomics in Budding Yeast 査読

    Ohya Y., Kimori Y., Okada H., Ohnuki S.

    Molecular Biology of the Cell26   3920 - 3925   2015年11月

  • Irradiation-injured Brain Tissues Can Self-Renew in The Absence of The Pivotal Tumor Suppressor p53 in The Medaka (Oryzias latipes) Embryo 査読

    Yasuda T., Kimori Y., Nagata K., Igarashi K., Watanabe-Asaka T., Oda S., Mitani H.

    Journal of Radiation Research57   9 - 15   2016年1月

  • Quantifying Morphological Features of Actin Cytoskeletal Filaments in Plant Cells Based on Mathematical Morphology 査読

    Kimori Y., Hikino K., Nishimura M., Mano S.

    Journal of Theoretical Biology389   123 - 131   2016年1月

  • Ultrastructure of Compacted DNA in Cyanobacteria by High-Voltage Cryo-Electron Tomography 査読

    Murata K., Hagiwara S., Kimori Y., Kaneko Y.

    Scientific Reports6   34934   2016年10月

  • Rabies Virus‐Mediated Oligodendrocyte Labeling Reveals A Single Oligodendrocyte Myelinates Axons from Distinct Brain Regions 査読

    Osanai Y., Shimizu T., Mori T., Yoshimura Y., Hatanaka N., Nambu A., Kimori Y., Kobayashi K., Ikenaka K.

    Glia65   93 - 105   2017年1月

  • YTH-RNA-binding protein prevents deleterious expression of meiotic proteins by tethering their mRNAs to nuclear foci 査読

    Shichino Y., Otsubo Y., Kimori Y., Yamamoto M., Yamashita A.

    eLife7   e32155   2018年2月

  • Different Activity Patterns in Retinal Ganglion Cells of TRPM1 and mGluR6 Knockout Mice 査読

    Takeuchi H., Horie S., Moritoh S., Matsushima H., Hori T., Kimori Y., Kitano K.,Tsubo Y., Tachibana M., Koike C.

    BioMed Research International   2963232   2018年5月

  • ANGUSTIFOLIA contributes to the regulation of three-dimensional morphogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha 査読

    Furuya T., Hattori K., Kimori Y., Ishida S., Nishihama R., Kohchi T., Tsukaya H.

    Development145 ( 18 ) dev161398   2018年9月

  • Endoplasmic Reticulum (ER) Membrane Proteins (LUNAPARKs) are Required for Proper Configuration of the Cortical ER Network in Plant Cells 査読

    Ueda H., Ohta N., Kimori Y., Uchida T., Shimada T., Tamura K., Hara-Nishimura I.

    Plant and Cell Physiology59 ( 10 ) 1931 - 1941   2018年10月

  • Heterogeneous distribution of doublecortin‐expressing cells surrounding the rostral migratory stream in the juvenile mouse 査読

    Aoyagi Y. Hibi T., Kimori Y., Sawada M., Kawakami R., Sawamoto K., Nemoto T.

    Journal of Comparative Neurology526 ( 16 ) 2631 - 2646   2018年11月

  • Length of myelin internodes of individual oligodendrocytes is controlled by microenvironment influenced by normal and input‐deprived axonal activities in sensory deprived mouse models 査読

    Osanai Y., Shimizu T., Mori T., Hatanaka N., Kimori Y., Kobayashi K., Koyama S., Yoshimura Y., Nambu A., Ikenaka K.

    Glia66 ( 11 ) 2514 - 2525   2018年9月

  • Implications of maintenance of mother-bud neck size in diverse vital processes of Saccharomyces cerevisiae 査読

    Kubo K., Okada H., Shimamoto T., Kimori Y., Mizunuma M., Bi E., Ohnuki S., Ohya Y.

    Current Genetics   1 - 15   2018年7月

  • Autophagy controls reactive oxygen species homeostasis in guard cells that is essential for stomatal opening. 査読

    Yamauchi S., Mano S., Oikawa K., Hikino K., Teshima K.M., Kimori Y., Nishimura M., Shimazaki K.I., Takemiya A.

    Proceedings of the National Academy of Sciences116 ( 38 ) 19187 - 19192   2019年9月

  • Noninvasive measurement of cell/colony motion using image analysis methods to evaluate the proliferative capacity of oral keratinocytes as a tool for quality control in regenerative medicine. 査読

    Hoshikawa E., Sato T., Kimori Y., Suzuki A., Haga K., Kato H., Tabeta K., Nanba D., Izumi K.

    Journal of tissue engineering10   2041731419881528   2019年10月

  • A method for evaluating three-dimensional morphological features: a case study using Marchantia polymorpha. 査読

    Furuya T., Kimori Y., Tsukaya H.

    Frontiers in plant science10   1214   2019年10月

  • A morphological image processing method to improve the visibility of pulmonary nodules on chest radiographic images. 査読

    Kimori Y.

    Biomedical Signal Processing and Control57   101744   2020年3月

  • Dynamic Capture-and-Release of Endoplasmic Reticulum Exit Sites by Golgi Stacks in Arabidopsis 査読

    Junpei Takagi, Yoshitaka Kimori, Tomoo Shimada, Ikuko Hara-Nishimura

    iScience23 ( 7 ) 101265   2020年7月

  • Thermosensitive TRPV4 channels mediate temperature-dependent microglia movement 査読

    Rei Nishimoto, Sandra Derouiche, Kei Eto, Aykut Deveci, Makiko Kashio, Yoshitaka Kimori, Yoshikazu Matsuoka, Hiroshi Morimatsu, Junichi Nabekura, Makoto Tominaga

    Proceedings of the National Academy of Sciences118 ( 17 ) e201289411   2021年4月

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書籍等出版物

  • 非線形画像・信号処理 (モルフォロジの基礎と応用)

    浅野晃,浅野(村木)千恵,木森義隆,棟安実治,延原肇,藤尾光彦( 担当: 共著 ,  範囲: 第4章2節「バイオイメージングへの応用」,pp. 87-94,第5章2節「ライブセルイメージング」,pp. 123-126.)

    丸善株式会社  2010年10月 

  • Using image-based resources: databases for plant organelle dynamics, and applications based on image information, In Introduction to Sequence and Genome Analysis I

    Mano S., Kimori Y., Takeda T., Miwa T., Nishikawa S., Mimura T.( 担当: 共著 ,  範囲: 第3章「Morphological Image Processing for the Quantitative Analysis of Biological Images」, pp. 90-99.)

    iConcept Press  2013年7月 

MISC

  • 人間の視覚処理を模した新たな顕微鏡画像処理法

    木森義隆,片山栄作

    生物物理48   125 - 130   2008年3月

  • Mathematical Morphologyに基づくバイオイメージからの構造情報の抽出と解析

    木森義隆,諸根信弘,片山栄作

    顕微鏡44   41 - 46   2009年5月

  • 出芽酵母で拡がる細胞の画像解析研究

    大矢禎一,木森義隆

    映像情報メディア学会誌67   765 - 770   2013年9月

  • 「定量化」時代の生物画像処理

    木森義隆

    顕微鏡50   54 - 60   2015年4月

講演・口頭発表等

  • 生物医学画像の情報処理,AI技術の展望

    木森義隆

    文部科学省 新学術領域研究 2018年度市民公開シンポジウム AIが変える医学の未来 (ミライ) -人工知能と診断の交差点-  文部科学省新学術領域研究 学術研究支援基盤形成 生命科学連携推進協議会

  • 生物顕微鏡画像における形態情報の抽出とその数量的表現

    木森義隆

    日本植物学会第82回大会  日本植物学会

  • Quantitative measurement of mobility of cell colony using image analysis methods for quality control of oral keratinocytes: A preliminary study 国際会議

    5th Tissue Engineering and Regenerative Medicine International Society World Congress 

  • 数理形態学を用いたバイオイメージ・インフォ マティクス

    木森義隆

    日本オペレーションズ・リサーチ学会「数理的発想とその実践」 第1回研究集会  日本オペレーションズ・リサーチ学会

 

担当経験のある授業科目

  • 画像情報処理論

    機関名:福井工業大学

  • プログラミング実習Ⅲ (C++言語)

    機関名:福井工業大学

  • プログラミング実習Ⅳ (C++言語)

    機関名:福井工業大学

  • コンピュータアーキテクチャ

    機関名:福井工業大学

  • 情報社会特論 (大学院)

    機関名:福井工業大学

  • 情報工学特論 (大学院)

    機関名:福井工業大学

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